从这个时候开始，大明便动荡不安了起来，各种各样的天灾会进一步吞噬大明的寿命。百姓流离失所，如果没有什么作为，农民起义的大火迟早都会星星燎原。

万历三年，这一年地球倒是太平了，可是朝廷又不太平了。

彻底掌握了朝廷的张居正开始了大规模的清洗，官员致士的致士，罢官的罢官，张居正开始大规模的提拔自己的人。整个大明朝的官场改天换地，正是步入张居正时代。

东南亚的战争进行的如火如荼，林凤与西班牙人的战斗越发的激烈了起来。

势单力孤的林凤在菲律宾兵败以后，引兵内犯，曾到达柘林，靖海，碣石等地。同时也到达过福建等处，依台湾魍港为基地四处劫掠。但是当时福建方面打击海盗很严厉，林凤四处碰壁，只得离去。

胡守仁再次击败林凤，林凤引兵退至广东进犯潮州。当时潮州的参政金浙主抚，林凤本人也看见了闽广两省的水师力量很大，意冷心灰不作进一步的抵抗准备。

于是林凤的手下马志善，李成等一千七百一十二人被招降，六百六十八名男女百姓被收容。林凤素知中国传统以来对待所谓盗贼毫不留情，只身逃往外洋，下落不明。

大明朝无论是官方还是私人，暂时退出了东南亚的殖民争夺。

只不过大明海贸利益太丰厚，在林凤之后，大明的沿海又一位大海盗崛起了，这个人就是李旦。李旦通过与倭国的贸易发家，他支持了倭国的德川家康统一倭国。

李旦借由日本海盗集团帮助，筹组武装船队，于日本、中国大陆、台湾、东南亚间与荷兰、英国所经营船只从事国际贸易往来，除此，也从事海盗掠夺行为。

因海上作风强悍，被西洋人取昵称为“Captain China”中国船长），或称甲必丹李旦。“甲必丹”（Captain）一词，为西班牙人统治马尼拉时期，对汉人领袖的称呼。

这些事情都是朱翊钧让澳门的情报人员搜集的消息，李旦崛起的很迅速，朱翊钧相信这后面绝对有东南豪族的支持。

万历四年，朝廷一切都很顺畅，北疆因为有戚继光在，一切都非常的平稳。

董狐狸被戚继光彻底打服了，董狐狸穿素服跑到戚继光那里大哭请降，戚继光与部下商议后决定接受其投降，董狐狸于是将劫掠的百姓放回，并发誓不再反叛，自此董狐狸与董长昂再也不敢侵犯蓟门。

戚继光镇守的蓟门固若金汤，北蛮子无法攻入，于是转而进犯辽东，戚继光率兵增援，协助辽东守将李成梁将其击退。

有了戚继光的帮忙，李成梁在辽东发展了起来，建州女真也被压了下去，大明的北疆暂时安稳了下来。只不过朱翊钧知道，这些都是暂时的。

这一年，朱翊钧同样收到了来自澳门的消息，葡萄牙人在澳门成立了天主教区，正是开始再大明传教。

虽然磕磕绊绊，但是大明迈入了万历五年，一个注定被历史铭记的年份。