小刚：《神奇宝贝无印篇》至《神奇宝贝DP》主角，曾是尼比市的道馆训练家。他与小智打完道场赛后次与小智一起旅行。从尼比市出发时，目标是神奇宝贝饲育家。他很擅长家务和料理，而且比其他人更神奇宝贝的知识。小刚很迷恋年龄比他大的大姐姐，不过每次都被拒绝，经常会在求爱的时候被小霞揪着耳朵拖走。在神奥联盟后的一次事件令他改变志向，令他立志成为神奇宝贝医生。

小建：《神奇宝贝无印篇之橘子联盟》主角，是神奇宝贝观察家，随身带着一本写生簿，随时神奇宝贝的各种生态，在橘子群岛的澎柑岛遇到了小智和小霞，便加入旅行行列希望见到大木博士，在小智成功挑战橘子联盟回到真新镇后，小建留在大木研究所做大木博士的助手，之后小智出发去其他地区时，把神奇宝贝都交给他管理，得力助手是小智的妙蛙种子。

小遥：《神奇宝贝超世代》主角，年龄约10岁。父亲是丰缘地区橙华道馆的训练家千里，为了成为独立神奇宝贝训练家而展开旅程，虽然刚满10岁训练年龄，但是还是得拿神奇宝贝做修行，老实说她几乎神奇宝贝一窍不通，所以有时也会闹出笑话来。因最心爱的越野脚踏车被小智的皮卡丘的强大电击烧焦而一起同行。个性开朗，但有时很糊涂。后来决定挑战华丽大赛，以大型庆典和顶尖协调训练家为目标旅行。

小胜：《神奇宝贝超世代》主角。小遥的弟弟，7岁，持有精灵领航员的人。喜欢神奇宝贝，了解很多专业知识。但是说话也很不客气。有时会指导姐姐小遥，但也常被小遥和她的神奇宝贝给修理一顿。很注意小刚照顾神奇宝贝的方式和方法。梦想是成为像父亲一样杰出的道馆训练家。

小光：《神奇宝贝钻石与珍珠》主角。住在神奥地方双叶镇的10岁女孩。以成为协调训练家为目标出发旅行，和小智一起旅行的同伴之一。她的目标是成为顶尖的协调训练家，跟她母亲彩子一样。她的神奇宝贝是从山梨博士处获得的波加曼。小光在旅行中参加各地的华丽大赛，陆续收话到了全部的五个缎带，终于在梦想的华丽大型庆典出场。口头禅是“没问题”，但事实上，当她说“没问题”的时候就是最有问题、最危险的时候。

艾莉丝：《神奇宝贝超级愿望》主角。喜欢爬树，精通树果，具有野生的行动力的女孩子，身手极为敏捷，故乡是合众地方的双龙市。受村里的老奶奶指点，和年幼的龙系神奇宝贝牙牙一起旅行和成长。在鹿子镇附近与小智邂逅，后来在三曜市接受了小智和天桐的邀请便结伴而行。对小智的评价是“真是个小孩”。艾莉丝是个野性少女，她喜欢荡摇在藤蔓，也喜欢吃浆果。旅行的时候，她的神奇宝贝以及朋友牙牙不躲在精灵球里，而隐藏在她头发中。艾莉丝非常活跃，她有时会在树迅速地爬树，她也喜冒险，并且很大胆。

天桐：《神奇宝贝超级愿望》主角。具有丰富的知识和经验，可以诊断训练家神奇宝贝之间关系并做出建议的A神奇宝贝服务生，同时也是三曜道馆的道馆训练家之一（与其他两位道馆训练家寇恩和伯特为三胞胎兄弟），和自己的兄弟都非常受少女们的欢迎。他的对战方式是大胆加上华丽。天桐是A级的神奇宝贝酒侍，会鉴定神奇宝贝和它的训练家的适合度。他神奇宝贝（特别是合众地方的神奇宝贝）的知识丰富。谈到神奇宝贝的内容，他跟他兄弟喜欢神奇宝贝跟茶或者酒联系起来。

莎莉娜：《神奇宝贝XY》主角，来自卡洛斯地区的时尚少女，是小智在卡洛斯地方旅途中一起旅行的同伴之一。幼年时期曾与小智参加过同一个训练营，在一次迷路时腿受伤的情况下小智帮莎莉娜绑了绷带，并且从小智那得到鼓舞，这让莎莉娜印象深刻。在电视直播中看到小智的身影后，决定追随小智的脚步进行旅行。从母亲那里掌握了铁甲犀牛大赛的知识和技能，但是没有往那方面发展的意思。会做饭也了解流行知识，在旅行时担当向导。欣赏小智气势如虹的性格，因为小时候的事情对他有些好感。

希特隆：《神奇宝贝XY》主角，来自卡洛斯地区的密阿雷，是柚莉嘉的哥哥，是小智在卡洛斯地区旅行的同伴之一，是密阿雷市的道馆训练家，也是一个科学爱好者，但除了长尾怪手手臂、希特隆二号机器人之外，其他发明总在使用后坏掉，留下希特隆二号管理道馆，并与小智许下“小智拿到四个徽章后便于他挑战”的承诺。

柚莉嘉：《神奇宝贝XY》主角，来自卡洛斯地区的密阿雷市，是希特隆的妹妹，是小智在卡洛斯地区旅行的同伴之一，性格坚毅，是一个可靠的小女孩，由于未满十岁，还神奇宝贝训练家，她只能“保管”希特隆的神奇宝贝，对于邂逅新的神奇宝贝感到兴奋，尽管她不能拥有神奇宝贝，但她尽自己所能参加各种活动，十分享受照顾神奇宝贝的过程。

莉莉艾：《神奇宝贝太阳月亮》主角，小智的同班同学。莉莉艾十分喜欢神奇宝贝，但却因为某些缘故不能触碰他们。不过要论神奇宝贝知识的话她是学校里的第一名。

卡奇：《神奇宝贝太阳月亮》主角，小智的同班同学。卡奇热爱火属性的神奇宝贝。他的家里经营神奇宝贝牧场，上学之外的时间会在牧场里帮忙。

玛奥：《神奇宝贝太阳月亮》主角，小智的同班同学。玛奥喜欢草属性的神奇宝贝。热情活泼的她做事有些马马虎虎的，积极的在自家经营的小店“爱纳食堂”担任看板娘。

水莲：《神奇宝贝太阳月亮》主角，小智的同班同学。水莲喜欢水属性的神奇宝贝。表面上性格腼腆的她其实是个行动派，是镇上渔夫家三位女儿的长女。

马玛内：《神奇宝贝太阳月亮》主角，小智的同班同学。马玛内喜欢电属性的神奇宝贝。醉心于理科的极客少年，会彻底的分析需要研究的事情。